水族地区的森林覆盖率在20%以上。在三都、榕江、从江、雷山等县的部分乡镇,森林覆盖率甚至高达70%-80%,形成除河流、耕地和村寨之外,处处皆森林的自然生态景观。三都的瑶人山和荔波的茂兰喀斯特原始森林,是
贵州著名的国家级森林公园和自然保护区。瑶人山总面积350平方公里,主峰海拔1365.9米,海拔1000米以上的山峰63座,群峰连绵,竞相耸立,整个地势中部高,四面逐渐低缓,山青水秀,气势雄伟。瑶人山在
植物区系、历史地理生态的研究方面具有较高的科学价值,现在还保存着第三纪古热带的古老树种,区域内仅木本
植物及主要树种达79科,207属,431种,多数列为国家一、二类保护的珍稀树种;主要药用
植物有25种。瑶人山生态状况良好,森林植被率在90%以上。荔波的茂兰喀斯特原始森林保护区,位于荔波县东南面,东西宽22.8公里,南北长21.8公里。总面积19639.1公顷,森林覆盖率达97.56%,保护区内
植物种属十分丰富,已经鉴定的维管束
植物有148科,408属,801种。区域内生长的荔波大节竹、黔桂穗花杉、荔波山橙、荔波球兰、石山木莲、荔波桑、网脉楠、荔波鹅耳枥等树种为区内独有;此外,南方红豆杉、香果树、篦子三尖杉、福建柏、黄枝油杉、喙
核桃、鹅掌揪、杜仲等皆为国家一、二类保护树种。保护区内森林基本上属于原生植被,是一个理想的生物基因库。除林木植被外,保护区内的大型真菌、中草药、苔鲜
植物等遍地可见,千姿百态。在野生动物资源中
兽类有7目、17科、27属、34种;
鸟类12目、28科、103种;两柄类有2目、6科、6属、19种;鱼类有4目、7科、17种;爬行类有2目、8科、24属、39种;
昆虫类17目、89科、289种。茂兰喀斯特原始森林保护区被誉为地球
腰带上的
绿色宝珠,区内有着地球同一纬度独一无二的漏斗森林、洼地森林、谷地森林及槽谷森林四大类型的喀斯特森林地貌景观。