科尔沁蒙古人为万户汗廷卫士之一的箭筒士。后来，哈巴图哈撒儿后裔称其属民为科尔沁部落。成吉思汗建立大蒙古国后，哈巴图哈撒儿分得四千户属民，驻牧于额尔古纳河右岸、海拉尔河、呼伦湖一带。哈撒儿后裔被封为齐王，成为东道诸王之一，地位显赫，后来迁至岭北形成阿鲁部落。16世纪中叶，部分科尔沁在哈巴图哈撒儿第十四世孙奎猛克塔斯哈喇带领下，迁至嫩江流域，号称“嫩（嫩江）科尔沁”。自17世纪初，嫩科尔沁诸部开始与建州女真、爱新国（后来的清帝国）友好往来，确立了联姻关系。1626年，爱新国主努尔哈赤授嫩科尔沁首领奥巴为土谢图汗，1630年，从嫩江流域南迁西拉沐沦下游、辽河流域。1636年至1650年间，清朝陆续把原嫩科尔沁左右翼诸部编为前、中、后六个扎萨克旗，其中科尔沁左翼后旗、科尔沁左翼中旗和科尔沁右翼前旗、科尔沁右翼中旗及扎赛特旗等5个旗与西拉沐沦流域其他部落一同保留了传统蒙古族刺绣特点。