侗锦纹饰的色彩运用比较特别，除了彩色锦之外，还有素色锦。素色侗锦，一般用黑白两色经纬线交织而成，也有用土红、粉红、浅蓝等色纱线与白经纱交织而成的。彩色侗锦，一般是以黑、深蓝色或白色为底，以黑白、水红、粉绿、湖蓝、橘黄等颜色配色纹饰。侗锦纹饰色彩运用的一个突出特点就是用色较浅，两色交接处有过渡，不像壮锦那样对比强烈。侗锦的几何骨架一般用白色，只有在浅地的情况下用其他颜色，在整体上显得冷暖结合，清新淡雅。

在色彩选取层面，侗锦纹饰选用的色彩纵然因各个区域有别而存在差异，整体用色上划分成无彩色素锦与有彩色彩锦。通常来讲，素锦、头帕等多数是采用黑、白、蓝等冷色调棉线，呈现出传统的淳朴风俗。相比而言，彩锦多数是选择颜色鲜艳的暖色系棉线编织，色彩搭配上面明艳、靓丽，一般用在小面积对比色，让色彩融汇在和谐变化中。将两种联合起来，就形成了不同的多彩侗锦，彩素连合、冷暖适宜的艺术风格。冷暖相对在视觉上形成层次感，暖色蕴含着前进、伸张感，而冷色则呈现退却、紧缩感。