随后，藏传佛教开始覆盖蒙古高原，渗透到蒙古族人民的思想和生活当中，在蒙古族的政治、经济、艺术、文化与社会等各方面打下了藏传佛教的烙印。翁牛特部皈依格鲁派是发生在17世纪上半叶的历史事件。真正使翁牛特部皈依格鲁派的重要人物是厄鲁特蒙古土尔扈特部贵族出身的托音喇嘛内齐。从清朝康熙年间开始藏传佛教在翁牛特旗得到迅速的发展兴盛，“康熙三十年（1691年），青海大喇嘛帕•丹巴来翁牛特旗布教，在其倡导下，于东部莲花吐他拉修建了第一座喇嘛庙。其后，旗内又陆续修了一些庙宇。到清末统计，全旗共建喇嘛庙19座，连同民国初年修建的2座，共有喇嘛庙21座。”其中的莲花吐庙总揽全旗喇嘛庙事宜，后清雍正十年（1732年）建立梵宗寺，接替莲花吐庙总揽全旗喇嘛庙务。此庙坐落在今乌丹镇西北四公里查干布热北山，建成后，由乾隆帝亲自赐名为“梵宗寺”，并被旗扎萨克定位旗庙，受北京雍和宫直接统辖，主持喇嘛定期去雍和宫汇报教务，请示机宜。梵宗寺的年中行事除节日活动和例行的法会、诵经以外还有一年一度的庙会，每年农历六月初八至十六。清亡，翁牛特旗藏传佛教渐衰，民国年间，喇嘛人数逐渐减少。有去参军的或到地方政府工作，还有还俗务牧，其中绝大多数都不再从事宗教活动。

明清两代，堆绫达到历史的辉煌。清代皇袍上有堆绫子加绣花做点缀的，宫内、贵族的衣物、桌围、帐幔、褡裢、枕顶、扇子套等日用品的装饰中常用堆绫绣。清东陵慈禧墓即出土了精美的带有堆绫绣的衣物。明清时期各大、小寺庙的佛事用品也常用堆绫工艺制作。北京白塔寺曾出土了一件清朝初期的袈裟，就是堆绫、珠绣和刺绣结合的精品，其上有堆绫工艺做出的莲花、寿桃、菊花、嗽叭花等十二种花卉，花形饱满，色彩和谐。据传说北京雍和宫内有清朝乾隆皇太后亲手制作的堆绫珍品“绿度母”，至今此贴绢施绣的佛像还熠熠生辉，吸引游人驻足观赏。