漳州木版年画雕版用材多为质地坚硬、纹理细密的梨仔木、红柯木、石榴木等。这些木料质地细腻，不易弯曲磨损。为省料、减轻重量、便于收藏，画版多呈不规则形状。雕刻前先对木版进行加工处理，再将画稿反贴在木板上，晾干后用目贼草（中药名）略微磨薄，使画稿线条清晰可见，然后开始雕刻。雕刻时，刻刀要运转自如，刻线要挺拔流畅，人物面部的刻线还需分出阴阳，衣纹也要显出刀锋。墨线刻成上细下宽的楔形，以防因木版涨缩导致线条断裂。刻版时还要注意控制线纹凸起的坡度，保证在刷墨印线时，线条交叉拐角处不积水污纸。最后出渣净底。每道工序都要精工细作，直至底版平滑、光洁，雕版才算完成。由于多年不再雕刻新版，漳州木版年画雕版技艺目前也面临着失传的危险。现存的画版基本都是民国以前的老画版，在闽南其他地区传统年画与画版消亡殆尽的情况下，这批画版更显珍贵。

漳州木版年画的雕版多选用质地坚硬、纹理细腻、不易弯曲磨损的梨仔、红柯、石榴等优质木材。这些木材均属于生长缓慢的树种，产量有限。用来雕刻墨线版的材料表面必须没有节疤、裂痕、虫孔等瑕疵，有瑕疵的材料只能用做套色版。为节省材料、减轻重量、便于查找，漳州木版年画现存的雕版多为双面雕版，且画版外形多呈不规则形状。一般而言，双面雕版所用版材较厚，约为5厘米，单面雕版所用材料略薄，约3厘米。雕刻前先将木头裁成3-5厘米厚的木板，然后放到水池中浸泡30-40天，取出晾干，再加以烘干处理后方能使用。如果没有合适的材料做较大的雕版，就必须将木板拼合粘接起来制作成较大的版材。