多种高纯度色彩的搭配，对于作品的创造者而言是对其美感的考验。色彩的搭配法则，一般色彩越少，搭配起来就越简单，反之则难以驾驭，因为它们之间会产生较多不易搭配的对比色（色相环内距离为120°左右的色彩）和补色(色相环距离为180°的色彩）。马尾绣的绣品中基本上都有黄、紫、绿、蓝、红色的出现，红色与绿色、紫色与黄色互为补色。这种色彩搭配在中国传统艺术中较少发现，与中国传统文人墨客提倡的素雅之美背道而驰。而在中国民间艺术中，人们却喜爱这种浓重的色彩搭配。经过长久的实践和长期的经验累积，这些民族逐渐掌握了互补色、邻近色的搭配规律，对色彩进行了协调。各民族民间艺术所使用的协调方式不尽相同，而水族马尾绣的协调方式更为合理、更为聪颖，也更为直接。首先马尾绣绣法，就是一种对于互补色、邻近色的协调方式。马尾绣是先用白色的丝线缠绕马尾，制作出绣线，用其勾勒出外形，再用多种高纯度的丝线在图形中填心。这样的制作过程，从色彩的角度而言，实际上是用一种无色相的颜色（黑、白、灰、金、银色）对表现对象进行勾边处理，将图形中的多种颜色加以区分，缓和多种颜色出现的违和感。这种方式非常简单易学，并且不会对图形造成过多的影响。其次是改变其中一个颜色的面积。在马尾绣常用的几种颜色当中，基本上绣品大部分面积都是以红色为主，黄色为之呼应，绿色、蓝色为之点缀，主次关系清晰明了。经过以上方法的处理，在近观马尾绣时，明显能够感受到所用色彩的浓重、秀丽，以及色彩关系的细腻，给人以细致、多彩的视觉感受。