明初，封建中央王朝在确立对瑶族地区的统治后，便在瑶族地区设立卫所，卫所作为军事机构，其任务是驻军戍守边疆，这是封建王朝设置卫所的宗旨。但对于经济发展相当落后的瑶族地区来说，卫所的设置在客观上推动了瑶族地区的社会经济发展，改变了社会结构。明代在瑶族地区的卫所屯田，屯田田亩一部分是夺取曾起义反抗、后被镇压的瑶族人民的良田，“将就近田地给与戍兵耕种”，“给以牛具种子，资以数目之粮，使且耕且守……大招百姓而填实其中，与兵同耕。”一部分屯田田亩则是通过垦荒而得。明代在瑶族地区的屯田，既开拓了瑶族地区的部分荒山，同时客观上也示范、推广了汉族地区的先进生产技术，有利于瑶族地区社会生产力的提高。明代瑶区屯田，除士兵外，还招募汉族和“熟僮”“同住耕种”，或征调大批偃兵到瑶族地区“且耕且戍”，或“招僮户耕牧其中”，“以其田或招农民或给粮户耕种”。大量汉、壮族人口的迁人，使瑶族地区既面临着汉、壮族先进文化的影响，推动瑶族社会向前发展；同时，也使瑶族社会结构发生变化，社会矛盾更为错综复杂。