毛泽东在六十年代有鉴于宗教在历史上对社会和文化的巨大影响，曾指示要开展和加强对宗教的研究。他说过一句有名的话：如果不批判神学，就写不好世界史、文学史和哲学史。如果当时的人们（特别是政治领导人）用辩证法的科学精神来理解作为学术研究方法的“批判”，把对宗教神学的批判理解为对宗教进行理性的探讨，理解为非独断的分析和辩证的扬弃，那末，毛泽东的这段话本可成为对我国宗教研究事业的一次有力的推动，促使社会科学工作者深入研究宗教对学术文化和社会生活的影响，考察宗教与社会、宗教与人生、宗教与文化、宗教与哲学……的关系，这就不仅可以大大推动马克思主义宗教理论的研究，而且可以促进整个哲学社会科学的全面发展。但不幸的是，事物的发展却走到了相反的方向。从五十年代后期到十年大动乱，泛滥于中国大地的企图立即实现共产主义的狂想，诱发了消灭一切传统文化和非马克思主义思想的文化专制主义，表现在宗教领域则导致用行政手段消灭宗教的运动。在这种情况下，毛泽东关于“批判神学”的指示必然超出世界观上有神无神、唯心唯物的理论之争的范围，学术上对宗教的批判研究变成了政治上的否定和打倒。马克思主义的宗教理论体系，党的宗教信仰自由政策被破坏无遗。不仅宗教界爱国人士和广大宗教信仰者身受其害，而且马克思主义的宗教研究工作者也不遑宁处。个别学者的宗教研究只能在风雨如磐的环境下，凭借个人的意志和毅力艰难地进行。