图腾崇拜往往指氏族与某种动物或植物有亲缘关系，形成了该氏族特定的图腾物。它是在原始宗教的背景下产生和发展的，图腾象征被作为氏族的祖先而受到敬奉，起到“守护神”的作用，成为凝聚族人精神的强有力中心。如旋涡纹、水波纹源自侗族的水崇拜；龙纹、螺旋纹源自侗族的龙崇拜与蛇崇拜；圆圈纹源自太阳崇拜；齿形纹源自山崇拜；云雷纹也与天崇拜、雷崇拜有关。侗族服饰的这些纹样早在新石器时代就形成了，有的纹样如鱼鳞纹、云雷纹、水波纹、圆圈纹、菱形纹等可以在新晃侗族自治县考古发现的新石器时代陶器上看到。它一方面包含着大量迷信色彩和愚昧观念，另一方面又与神话一起共同繁衍了民族文化艺术。马克思说：“任何神话都是用想象和借助想象以征服自然力，支配自然力，把自然力加以形象化”。它对民族服饰文化内涵的形成和发展起到了先入为主的决定性作用。侗族是一个农耕民族，特别崇拜与稻有关的自然物，侗锦中的谷粒纹就来源于此，流行于整个侗族地区“吃新节”的习俗就是谷物崇拜的反映。再者侗族是古代邻近的若干氏族交融繁衍而发展起来的，图腾崇拜多种多样，侗族古歌说到的“龟婆”孵松恩、松桑，松恩、松桑又生了虎、熊、蛇、龙、雷、猫、狐、猪、鸭、鸡、姜郎、姜妹12兄弟。这叙述了侗族先民各氏族发展的故事，龟、松桑，松恩及12子孙都可能是侗族先民图腾体系的组成部分，虽然母系制相应的图腾崇拜在进入父系制后已被祖先崇拜所代替，但人们对女祖先的崇拜依然存在，使得图腾崇拜也以侗锦图案等方式遗留下来。侗族许多地区还把鱼作为一种图腾，鱼在侗族人民的饮食和生活中扮演着极其重要的角色。如大年初一必须有鱼；结婚办喜事，男方到女方家定亲或迎娶必须有鱼；祭祖必须有鱼，守灵、送终必须有鱼，待葬期间不得吃荤，但可食鱼。在当地风俗中鱼代表着丰衣足食、多子多孙。鱼图腾演化出侗锦图案中的鱼骨纹、三角纹、菱形纹，其中三角纹和菱形纹乃由鱼的不同部位演化而成。侗族的图腾崇拜还表现在：龙（蛇）图腾崇拜、伞图腾崇拜、太阳图腾崇拜等等。侗族的图腾崇拜在侗锦图案中得到了淋漓尽致的体现，使得侗锦有了灵性的生命力。