事实上，水族在迁移和发展的过程中，也曾经不断融合了当地其他民族的因素。此外，历史上也有不同的族群由外地迁入水族定居地区。例如，明代实行兵食自给的卫所屯戍制度，大量汉族人入迁水族地区。明、清王朝政府还实行过大规模的垦荒移民政策，外省人也纷纷移居水族地区，这样一来，水族也就融合了不少异族群，通过杂居相处、通婚和相互影响等方式，最终才形成今天的水族。因此，现代的水族人中，有不少人都称其祖先是来自江南等地。