维吾尔族曾先后信奉过佛教、摩尼教、景教、祆教、道教和伊斯兰教等多种宗教。全真道首领邱处机由山东启程奔赴中亚，途经高昌回鹘之夏都北庭（今新疆吉木萨尔县北），在他撰写的《长春真人西行记》中对当地的宗教信仰状况有所描述，其中多次提到回鹘国中有道士存在，而且人数还不少，与回鹘王室关系密切。