到了晚期母系氏族社会，出现了农业、畜牧业、制陶、纺织等手工业，人类支配自然的能力大大提高了，如锄耕农业使原始人的生活比以前有了更可靠的保证，畜牧业使原始人取得奴役动物的重大胜利，从而增强了人的自主感和优越感。原始人开始认识到自身的力量，逐步把自己和周围的自然界区别开来。于是就出现了两种并行的崇拜，一是对自然精灵的崇拜，一是对祖先灵魂的崇拜。因为人和自然相区别，才有各自的独立灵魂。事实上，人在幻想中创造自己的灵魂时，也创造了自然界的灵魂。这时，灵魂在原始人的观念中已是可独立存在的个体灵体了。