在清代，中国汉族学者研究元史学颇有成就。1.钱大昕（1728—1804年）推许《蒙古秘史》和何秋涛（1824—1862年）校勘《圣武亲征录》，被视为元史学之两大纪念。钱氏从《永乐大典》中发现十五卷本《蒙古秘史》并公布于众，使元史研究有了新的史料；何氏校勘元代蒙文史书的汉译本《圣武亲征录》，使更多的元史学家能够利用该书。2.利用外文史料补充汉文史料之不足。中国元史学家，第一个接触外文史料的是洪钧（1839—1893年）。他出使俄国期间，正值波斯拉施特《史集》和英国人霍渥尔斯的《蒙古史》英文版出版。他请人翻译，著《元史译文正补》，使中国人研究元史扩大了视野。3.修补《元史》。钱大昕是清代研究元史的的第一代名人。他有志修改《元史》，但未果。他在元史方面的著作有《补元史氏族表》（三卷）、《补元史艺文志》（四卷），《元史拾遗》等。魏源（1794—1857年）是清代研究元史的第二代名人，著有《元史新编》九十五卷。屠寄也是清代研究元史的名人之一。他认为《元史》并不能盖括全部蒙古史，金帐汗国、伊儿汗国、察哈台汗国的历史并没有包括。他立志撰写一部概括整个蒙古的蒙古史，著有《蒙兀儿史记》，补充了《元史》所没有的内容。柯劭忞（1850—1933年）的《新元史》（共257卷）是清代元史研究成果的大集成。他吸收了钱大昕、魏源、何秋涛、李文田、洪钧、屠寄的研究成果。1922年当时的民国政府列入正史，并公开出版。4.考据《蒙古秘史》。清代有许多学者考注《蒙古秘史》，其中李文田（1834—1895年）最为著名。他利用正史十一种、宋代史料七种、金人著述一种、元代史料七种、明代史料十种、清代史料十七种、元人碑碣文字十一种，校注《蒙古秘史》，写出《元朝秘史注》十五卷，并于1898年发表。这是清代考据学的一大成就。张穆的《蒙古游牧记》是研究蒙古各部的社会历史和地理方位的专著。