在批判和清理“左”的错误思想的同时，在实践中彻底平反了20世纪50年代以后在历次政治运动中制造的各种冤、假、错案，并对历史遗留问题进行了清理。对在反右斗争扩大化中被打成地方民族主义分子的一律摘帽，给受迫害的少数民族爱国人士恢复名誉，对含冤去世的上层人士
家属给予抚恤。例如，
广西金秀
瑶族自治县从1979年开始，对“反右派”、“反右倾”、“四清”及“文化大革命”中的案件，按照“全错全改，部分错部分改，不错不改”的原则，进行全面复查。1958年所划的50名“右派分子”属全部错划，给予全部改正，恢复名誉，安排工作；对在“四清”和“文化大革命”等政治运动中错捕、错划、错处分的案件，均按政策予以纠正和平反。又如，
云南河口
瑶族自治县从1979年起，经过认真细致的复查、甄别，使错划的38名“右派分子”和24名“中右分子”得到改正，恢复名誉；公开平反“文化大革命”的38件错案；平反纠正历史旧案76件。对于影响特别大的瑶山“4•15”事件，中共红河州委、河口
瑶族自治县县委于1978年10月，组成联合调查组，对该案进行了调查。1979年1月20日，中共红河州委向中共
云南省委上报《关于对河口瑶山“4•15”错案的平反
报告》。该
报告认为：尽管李国恩、李梦庄两人犯有政治错误，但把群众上山定为“反革命暴乱”是错误的，应予以公开平反。又根据过去的一个线索，定了一个所谓“越法党”特务组织，经复查，是不存在的。“越法党”特务组织的结论应予以撤销。李国恩、李梦庄两人犯有政治错误，但构不成反革命分子，属于错杀，应予以平反，其
家属应予以抚恤。关押的人应予以释放，恢复名誉；被判监外执行由群众监督改造的，应当众宣布撤销；伤残人员，应按
省委有关文件办理；没收的火药枪和
财物，尚未退赔的，一律退赔，原物找不到的，作价
赔偿。1979年2月8日，中共
云南省委发出《关于对瑶山事件平反的通知》，同意中共红河州委《关于对河口瑶山“4•15”错案的平反
报告》。2月19日，中共红河州委发出《关于对河口县瑶山“4•15”错案的平反的通知》，宣布瑶山事件主要是推行林彪、“
四人帮”反革命路线，破坏共产党的民族政策造成的一个错案，下面是没有责任的。通知要求通过这一事件的平反，要组织各级党委、干部群众，学习中共十一届三中全会公报，认真总结经验教训，落实好共产党的各项政策，调动一切积极因素，加强民族团结，把瑶山地区的经济建设迅速搞上去。为了认真做好平反善后工作，中共红河州委又组织14人的工作组，由州委副书记李宗孔
带领到
瑶族山区帮助落实平反政策。经过一个多月认真细致的工作，凡事件涉及的人，全部落实了政策，共发放落实政策经费3万余元。