蒙古史研究方面，中国学者打破了侧重研究古代史或元史的传统，把研究范围扩展到近代和现代。内蒙古大学设有内蒙古近现代史研究所，出版了郝维民主编的《内蒙古近代简史》、《内蒙古自治区史》等专著。内蒙古大学的内蒙古近现代史研究所、内蒙古师范大学的历史系都招收内蒙古近代和现代史硕士研究生。史学研究涉猎蒙古史的各个方面的内容，如族源、社会性质、明和蒙古的关系，清对蒙古统治的评价，历史人物评价，蒙古的历史地位，历史上的民族关系，近代以来蒙古人民的反帝反封建反民族压迫的斗争和“独立”、“自治”运动等等诸问题。金锋编辑出版的《蒙古史论文选辑》（1—5卷），元史学会编的《元史论丛》，中国蒙古史学会编辑的四次会议论文集，反映了中国学者研究蒙古史的学术水平。亦邻真的《中国北方民族与蒙古族源》一文，对多年争论的蒙古族源问题进行探讨，得出了有益的见解。除专题研究外，通史和断代史研究亦取得了很大的成绩。五套丛书的《蒙古族简史》已出版，翁独健先生主持了这一工作。内蒙古社会科学院历史研究所编著出版了三卷本《蒙古族通史》（蒙汉）。韩儒林主编的《元朝史》继承了中国元史研究的传统，并以马克思主义史学观为指导，对元朝的历史做了全面、系统的论述。李干的《元朝社会经济史稿》，李志安的《元代的分封制度研究》，是元代史的专题研究专著。白翠琴的《瓦剌史》是研究明代卫拉特的专著。卫拉特史的研究近10年来引起中国学者的重视。内蒙古师范大学、新疆师范大学牵头，先后召开过三次全国性的卫拉特史学术讨论会。马汝珩、马大正合著的《漂落异域的民族》，专门论述了17至18世纪土尔扈特蒙古的历史。波•少布的《黑龙江蒙古研究》是研究黑龙江地区蒙古族历史、经济、文化等诸方面的专著。即将出版的《中国各民族传统文化百科全书•蒙古族卷》是概括蒙古学各领域的工具书。人物传记方面有赛熙亚乐的《成吉思汗史记》等。

中国共产党极为重视蒙古史的研究。早在抗日战争时期，即1940年左右在延安成立了民族问题研究会、蒙古文化促进会、蒙古文化陈列馆、成吉思汗纪念堂等，有组织有领导地研究蒙古问题。延安民族学院还开设蒙古语文课。在延安的马克思主义史学工作者研究蒙古的历史和社会问题，编著了《蒙古民族问题》一书（民族问题研究会编），探索了蒙古族社会历史发展的规律及民族关系，揭露和批判了日本帝国主义对蒙古民族的侵略压迫及国民党反动派的大汉族主义。该书是中国蒙古史学者用马克思主义观点撰写的第一部蒙古史专著。

16世纪末到17世纪70年代，是蒙古族学者研究蒙古史非常活跃的时期。这时，成吉思汗黄金家族的万世一统的统治发生危机，已临灭亡。蒙古族学者站在成吉思汗黄金家族的正统观立场上研究蒙古的历史，他们利用蒙文史料记载、民间口头传说，以佛教的世界观为理论指导，撰写蒙古的历史，宣扬成吉思汗黄金家族的万世一统的正统观，论证其皇位的不可动摇性。这时期的主要历史著作有《黄金史纲》、罗布桑丹津主编的《黄金史》，佚名作者的《大黄册》、善巴的《阿撒拉嘎齐史》、萨囊彻辰的《蒙古源流》等。