元明清时期，随着瑶族地区封建统治的加强，封建思想文化亦不断向瑶区渗透。受其影响，瑶族地区社会思想中的封建意识逐渐加重。同时，阶级斗争和民族斗争对这一时期的瑶族社会思想也有重大影响，人们在求助神灵和武装反抗的过程中，开始对封建统治阶级的本质有所认识，产生了朴素的哲学社会思想。