明清时期，瑶族受到佛教的影响，但信仰佛教剃度出家当和尚、尼姑的很少。佛教云门寺在乳源瑶族自治县建庙一千多年（南汉乾亨七年即923年文偃禅师创建，位于乳源瑶族自治县县城东北6公里的云门山慈悲峰下），对当地瑶族影响不大，瑶族人到云门寺上香的人很少。佛教对瑶族的影响，主要表现在瑶族道经里杂有少量观音经等佛经，还有些经书和民间典籍中有时出现“观世音”、“圣僧和尚”等概念。此外，在恭城、富川等平地瑶地区，一些瑶族有时到当地佛寺上香拜佛、求签。瑶族信奉佛教的人不多见，平常信教者也只在家中供佛念经，所供之佛多为“玉皇大帝”、“皇母娘娘”、“观音娘娘”（观音菩萨）等，很少出家和住寺。在供奉及请神时，往往自然神、祖宗神、道教神、佛教神一起供奉。