明清两朝苗族进入当政王朝的视野，明清时期云贵少数民族地区采取废除土司、改设流官的制度，加强了中央集权的统治，也促进了民族地区的生产发展。明成祖永乐十二年（1414）平定思训、思南两宣慰使之乱，设贵州布政使司，置司州、思南等八府。清代雍正年间大力推举“改土归流”政策，在黔东南设新疆六厅，封建中央王朝一系列的政治举措并没有彻底改变苗寨以血亲为纽带的氏族关系，当地曾流行这样一句民谣：