其次是直接吸收佛道神学。理学开创者周敦颐，其《太极图•易说》出自道教，其《爱莲说》由《华严经探玄记》脱胎而出。北宋五子之一邵雍，其学可上溯到道士陈搏的《先天图》。理学代表人物程颢、程颐赞美佛学“极尽乎高深”。又说：洒扫应对，便是形而上者，理无大小故也”，近似禅宗。又说“事理一致，微显一源”，类似华严。程颢曾云：“虽尧舜事业，亦只如太虚空中一点浮云过目”。程颐肯定华严宗圆融无碍的说法，并归纳为“万理归于一理”的命题。宋代理学最大代表者朱熹对《阴符经》、《周易参同契》均有精心研究，并称赞佛教说：“佛教最有精微动得人处。”，又说：“今之不为禅学者，只是未曾到那深处，才到深处，定走入禅去也。”朱熹的“理一分殊”之说，无疑受华严宗的启发，他说：“然虽各自有一个理，却又同出于一个理。”“释氏云‘一月普现一切水，一切水月一月摄’，这是那释氏也窥见得这些道理。”宋代心学大儒陆九渊蔑视儒经文字，声称“六经皆我注脚”。他反对朱熹“格物致知”的修养方法，斥为“支离事业”，主张直指本心、明心见性的简易功夫，颇有禅宗的风度，故世人称“陆学即禅学”。